毕竟直接对朱由校这个皇帝下手的话，成功的可能性也太低，一旦失败后的代价也很大，而且因为皇帝既是他们想对抗的人又是他们拥有特权的保障者，所以他们只能退而求其次对太听皇帝话的文官即方从哲下手。
所以，朱由校才说这些文官其实是在威胁他。
朱由校不得不承认，明朝后期的首辅之所以一个比一个没用，也不能全怪首辅自己，而是这个时代的本质决定了大多数权贵士绅们不喜欢强势的首辅，如同他们也不喜欢强势的皇帝一样。
毕竟这些文官更喜欢操控皇帝或者操控首辅成为自己的代理人。
“皇爷，元辅请求现在就见您，您看宣还是不宣？”
这时候，刘若愚疾步走了进来，请示着朱由校。
而朱由校则抬起深若黑潭的眼眸，点了点头。
没多久，方从哲就走了进来，双手持着奏本，呼吸略微有些急促，一来到朱由校面前就直接匍匐在地，而且还因为太过于急着下跪，而摔在了地上，嘴里却急不可耐地道：“臣见过陛下！”
朱由校斜眼瞥了他一眼：“朕知道你要来，赐座！”
刘若愚忙扶起了方从哲，且又扶着他坐在了一旁的软凳上。
方从哲欠身坐着，小心翼翼地递出奏本来：“臣是来递辞官疏的，求陛下准臣回乡吧。”
说到这里，方从哲就声音哽咽了起来，哆嗦着嘴，然后再次跪在了地上，脑门紧贴着冰冷的地砖。
朱由校没有明确回答方从哲，只说道：“朕知道他们是不想朕身边有一个听话的人，哪怕他们知道你方从哲离开朝堂朕也不会用他们，但他们也还是会除掉你方从哲，因为只有这样，他们才能逼迫所有在朕身边的人都是和他们站在一边的人，也只有如此，朕的旨意如果得不到他们的同意就出不了紫禁城！”
朱由校说着又道：“他们想把朕变成金丝雀，养在紫禁城这座牢笼里，用朕的名义去满足他们的私欲，却又把将来天下倾覆的锅扣在朕身上！”
方从哲听到这里，也不敢回答，毕竟他承认这是事实，但他自己也是文官，所以也不好直接表态承认我们就是想把皇帝软禁在紫禁城，只听我们的摆布。
朱由校则突然朝方从哲怒吼起来：“可朕不想被你们摆布！”
朱由校这么一吼，方从哲吓得颤抖了一下，脊背发凉。
而朱由校则直接一挥衣袖：“因为你们的贪得无厌已经让安宁太平的日子没多少了！你方从哲是京师大兴人，你应该清楚，城外有多少流民在饿死，这还是天子脚下，外面只会比这更惨！而关外边陲有多少不安分的势力在虎视眈眈，也在内阁这么多年，也比朕清楚！可到时候你们可以换下我大明的官袍重新为新朝效力，而朕的大明呢？”